| SMAD1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SMAD1, BSP-1, BSP1, JV4-1, JV41, MADH1, MADR1, SMAD family member 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601595 MGI: 109452 HomoloGene: 21196 GeneCards: SMAD1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • co-SMAD binding • protein homodimerization activity • I-SMAD binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein heterodimerization activity • protein kinase binding • sequence-specific DNA binding • DEAD/H-box RNA helicase binding • primary miRNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • integral component of membrane • SMAD protein complex • гіалоплазма • transcription regulator complex • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • nuclear inner membrane • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus • SMAD protein complex assembly • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • embryonic pattern specification • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • hindbrain development • cellular response to BMP stimulus • cardiac muscle cell proliferation • BMP signaling pathway • transcription, DNA-templated • MAPK cascade • protein phosphorylation • gamete generation • cartilage development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of cartilage development • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing • mesodermal cell fate commitment • inflammatory response • bone development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • midbrain development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • osteoblast fate commitment • homeostatic process • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • positive regulation of sprouting angiogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
н/д
| Хр. 8: 80.07 – 80.13 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
SMAD1 (англ. SMAD family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 260[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MNVTSLFSFT
|
|
SPAVKRLLGW
|
|
KQGDEEEKWA
|
|
EKAVDALVKK
|
|
LKKKKGAMEE
|
| LEKALSCPGQ
|
|
PSNCVTIPRS
|
|
LDGRLQVSHR
|
|
KGLPHVIYCR
|
|
VWRWPDLQSH
|
| HELKPLECCE
|
|
FPFGSKQKEV
|
|
CINPYHYKRV
|
|
ESPVLPPVLV
|
|
PRHSEYNPQH
|
| SLLAQFRNLG
|
|
QNEPHMPLNA
|
|
TFPDSFQQPN
|
|
SHPFPHSPNS
|
|
SYPNSPGSSS
|
| STYPHSPTSS
|
|
DPGSPFQMPA
|
|
DTPPPAYLPP
|
|
EDPMTQDGSQ
|
|
PMDTNMMAPP
|
| LPSEINRGDV
|
|
QAVAYEEPKH
|
|
WCSIVYYELN
|
|
NRVGEAFHAS
|
|
STSVLVDGFT
|
| DPSNNKNRFC
|
|
LGLLSNVNRN
|
|
STIENTRRHI
|
|
GKGVHLYYVG
|
|
GEVYAECLSD
|
| SSIFVQSRNC
|
|
NYHHGFHPTT
|
|
VCKIPSGCSL
|
|
KIFNNQEFAQ
|
|
LLAQSVNHGF
|
| ETVYELTKMC
|
|
TIRMSFVKGW
|
|
GAEYHRQDVT
|
|
STPCWIEIHL
|
|
HGPLQWLDKV
|
| LTQMGSPHNP
|
|
ISSVS
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Lechleider R.J., de Caestecker M.P., Dehejia A., Polymeropoulos M.H., Roberts A.B. (1996). Serine phosphorylation, chromosomal localization, and transforming growth factor-beta signal transduction by human bsp-1. J. Biol. Chem. 271: 17617—17620. PMID 8663601 doi:10.1074/jbc.271.30.17617
- Zhang Y., Feng X.-H., Wu R.-Y., Derynck R. (1996). Receptor-associated Mad homologues synergize as effectors of the TGF-beta response. Nature. 383: 168—172. PMID 8774881 doi:10.1038/383168a0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Kretzschmar M., Liu F., Hata A., Doody J., Massague J. (1997). The TGF-beta family mediator Smad1 is phosphorylated directly and activated functionally by the BMP receptor kinase. Genes Dev. 11: 984—995. PMID 9136927 doi:10.1101/gad.11.8.984
- Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 doi:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
- Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 doi:10.1016/S1359-6101(99)00012-X
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|