| RELB
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
1ZK9, 1ZKA, 2V2T, 3DO7, 3JSS, 3JUZ, 3JV0, 3JV4, 3JV6, 4JGM, 4JHB
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| RELB, I-REL, IREL, REL-B, RELB proto-oncogene, NF-kB subunit, IMD53 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 604758 MGI: 103289 HomoloGene: 4747 GeneCards: RELB
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• I-kappaB/NF-kappaB complex • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • центросома • GO:0009327 protein-containing complex • transcription repressor complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• response to cytokine • antigen processing and presentation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • myeloid dendritic cell differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 1 cell differentiation • negative regulation of interferon-beta production • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular response to osmotic stress • GO:1901313 positive regulation of gene expression • NIK/NF-kappaB signaling • T-helper 1 type immune response • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • вроджений імунітет • lymphocyte differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 45 – 45.04 Mb
| Хр. 7: 19.34 – 19.36 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
RELB (англ. RELB proto-oncogene, NF-kB subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 62 134[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLRSGPASGP
|
|
SVPTGRAMPS
|
|
RRVARPPAAP
|
|
ELGALGSPDL
|
|
SSLSLAVSRS
|
| TDELEIIDEY
|
|
IKENGFGLDG
|
|
GQPGPGEGLP
|
|
RLVSRGAASL
|
|
STVTLGPVAP
|
| PATPPPWGCP
|
|
LGRLVSPAPG
|
|
PGPQPHLVIT
|
|
EQPKQRGMRF
|
|
RYECEGRSAG
|
| SILGESSTEA
|
|
SKTLPAIELR
|
|
DCGGLREVEV
|
|
TACLVWKDWP
|
|
HRVHPHSLVG
|
| KDCTDGICRV
|
|
RLRPHVSPRH
|
|
SFNNLGIQCV
|
|
RKKEIEAAIE
|
|
RKIQLGIDPY
|
| NAGSLKNHQE
|
|
VDMNVVRICF
|
|
QASYRDQQGQ
|
|
MRRMDPVLSE
|
|
PVYDKKSTNT
|
| SELRICRINK
|
|
ESGPCTGGEE
|
|
LYLLCDKVQK
|
|
EDISVVFSRA
|
|
SWEGRADFSQ
|
| ADVHRQIAIV
|
|
FKTPPYEDLE
|
|
IVEPVTVNVF
|
|
LQRLTDGVCS
|
|
EPLPFTYLPR
|
| DHDSYGVDKK
|
|
RKRGMPDVLG
|
|
ELNSSDPHGI
|
|
ESKRRKKKPA
|
|
ILDHFLPNHG
|
| SGPFLPPSAL
|
|
LPDPDFFSGT
|
|
VSLPGLEPPG
|
|
GPDLLDDGFA
|
|
YDPTAPTLFT
|
| MLDLLPPAPP
|
|
HASAVVCSGG
|
|
AGAVVGETPG
|
|
PEPLTLDSYQ
|
|
APGPGDGGTA
|
| SLVGSNMFPN
|
|
HYREAAFGGG
|
|
LLSPGPEAT
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|