KLF10

KLF10
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EPA
Ідентифікатори
Символи	KLF10, EGR-alpha, EGRA, TIEG, TIEG1, Kruppel-like factor 10, Kruppel like factor 10
Зовнішні ІД	OMIM: 601878 MGI: 1101353 HomoloGene: 4135 GeneCards: KLF10
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• skeletal system development; • bone mineralization; • cellular response to peptide; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • ритмічний процес; • cell-cell signaling; • positive regulation of osteoclast differentiation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • циркадний ритм; • проліферація; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • negative regulation of cell population proliferation; • cellular response to starvation; • regulation of circadian rhythm; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7071
	21847
	ENSG00000155090
	ENSMUSG00000037465
	Q13118
	O89091
	NM_001032282; NM_005655
	NM_001289471; NM_013692; NM_001357677
	NP_001027453; NP_005646
	NP_001276400; NP_038720; NP_001344606
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KLF10 (англ. Kruppel like factor 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 52 555^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLNFGASLQQ	TAEERMEMIS	ERPKESMYSW	NKTAEKSDFE	AVEALMSMSC
SWKSDFKKYV	ENRPVTPVSD	LSEEENLLPG	TPDFHTIPAF	CLTPPYSPSD
FEPSQVSNLM	APAPSTVHFK	SLSDTAKPHI	AAPFKEEEKS	PVSAPKLPKA
QATSVIRHTA	DAQLCNHQTC	PMKAASILNY	QNNSFRRRTH	LNVEAARKNI
PCAAVSPNRS	KCERNTVADV	DEKASAALYD	FSVPSSETVI	CRSQPAPVSP
QQKSVLVSPP	AVSAGGVPPM	PVICQMVPLP	ANNPVVTTVV	PSTPPSQPPA
VCPPVVFMGT	QVPKGAVMFV	VPQPVVQSSK	PPVVSPNGTR	LSPIAPAPGF
SPSAAKVTPQ	IDSSRIRSHI	CSHPGCGKTY	FKSSHLKAHT	RTHTGEKPFS
CSWKGCERRF	ARSDELSRHR	RTHTGEKKFA	CPMCDRRFMR	SDHLTKHARR
HLSAKKLPNW	QMEVSKLNDI	ALPPTPAPTQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Blok L.J., Grossmann M.E., Perry J.E., Tindall D.J. (1995). Characterization of an early growth response gene, which encodes a zinc finger transcription factor, potentially involved in cell cycle regulation. Mol. Endocrinol. 9: 1610—1620. PMID 8584037 doi:10.1210/mend.9.11.8584037
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Johnsen S.A., Subramaniam M., Monroe D.G., Janknecht R., Spelsberg T.C. (2002). Modulation of transforming growth factor beta (TGFbeta)/Smad transcriptional responses through targeted degradation of TGFbeta-inducible early gene-1 by human seven in absentia homologue. J. Biol. Chem. 277: 30754—30759. PMID 12072443 doi:10.1074/jbc.M204812200
Chrisman H.R., Tindall D.J. (2003). Identification and characterization of a consensus DNA binding element for the zinc finger transcription factor TIEG/EGRalpha. DNA Cell Biol. 22: 187—199. PMID 12804117 doi:10.1089/104454903321655819

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11810 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13118 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11810 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q13118 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]