HMGB3

HMGB3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EQZ, 2YQI
Ідентифікатори
Символи	HMGB3, HMG-2a, HMG-4, HMG2A, HMG4, high mobility group box 3
Зовнішні ІД	OMIM: 300193 HomoloGene: 84734 GeneCards: HMGB3
Пов'язані генетичні захворювання
	X-linked colobomatous microphthalmia-microcephaly-intellectual disability-short stature syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • DNA binding, bending; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • four-way junction DNA binding; • RNA binding; • transcription factor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • хромосома;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • процес імунної системи; • DNA recombination; • вроджений імунітет; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • DNA geometric change; • negative regulation of B cell differentiation; • negative regulation of myeloid cell differentiation; • ремоделювання хроматину; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of innate immune response; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3149
	688583
	ENSG00000029993
	н/д
	O15347
	B0BN99
	NM_005342; NM_001301228; NM_001301229; NM_001301231
	XM_017588410; XM_017588411; XM_017599470; XM_017599471
	NP_001288157; NP_001288158; NP_001288160; NP_005333
	NP_001166812; NP_001385705; NP_001385706
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HMGB3 (англ. High mobility group box 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 22 980^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKGDPKKPK	GKMSAYAFFV	QTCREEHKKK	NPEVPVNFAE	FSKKCSERWK
TMSGKEKSKF	DEMAKADKVR	YDREMKDYGP	AKGGKKKKDP	NAPKRPPSGF
FLFCSEFRPK	IKSTNPGISI	GDVAKKLGEM	WNNLNDSEKQ	PYITKAAKLK
EKYEKDVADY	KSKGKFDGAK	GPAKVARKKV	EEEDEEEEEE	EEEEEEEEDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Wilke K., Wiemann S., Gaul R., Gong W., Poustka A. (1997). Isolation of human and mouse HMG2a cDNAs: evidence for an HMG2a-specific 3' untranslated region. Gene. 198: 269—274. PMID 9370291 doi:10.1016/S0378-1119(97)00324-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Antoine D.J., Harris H.E., Andersson U., Tracey K.J., Bianchi M.E. (2014). A systematic nomenclature for the redox states of high mobility group box (HMGB) proteins. Mol. Med. 20: 135—137. PMID 24531895 doi:10.2119/molmed.2014.00022

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HMGB3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5004 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-25 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O15347 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HMGB3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5004 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-25 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, O15347 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]