PAX5

PAX5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1K78, 1MDM
Ідентифікатори
Символи	PAX5, ALL3, BSAP, paired box 5, PAX-5
Зовнішні ІД	OMIM: 167414 MGI: 97489 HomoloGene: 56419 GeneCards: PAX5
Пов'язані генетичні захворювання
	артеріальна гіпертензія, ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • fibrillar center; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • lateral ventricle development; • GO:0010260 старіння людини; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку; • multicellular organism development; • adult behavior; • humoral immune response; • Сперматогенез; • negative regulation of histone H3-K9 methylation; • cerebral cortex development; • animal organ morphogenesis; • skeletal muscle cell differentiation; • embryonic cranial skeleton morphogenesis; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • regulation of B cell receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5079
	18507
	ENSG00000196092
	ENSMUSG00000014030
	Q02548
	Q02650
NM_001280547; NM_001280548; NM_001280549; NM_001280550; NM_001280551;
	NM_001280552; NM_001280553; NM_001280554; NM_001280555; NM_001280556; NM_016734
	NM_008782
NP_001267476; NP_001267477; NP_001267478; NP_001267479; NP_001267480;
	NP_001267481; NP_001267482; NP_001267483; NP_001267484; NP_001267485; NP_057953; NP_001267480.1
	NP_032808
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PAX5 (англ. Paired box 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 42 149^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLEKNYPTP	RTSRTGHGGV	NQLGGVFVNG	RPLPDVVRQR	IVELAHQGVR
PCDISRQLRV	SHGCVSKILG	RYYETGSIKP	GVIGGSKPKV	ATPKVVEKIA
EYKRQNPTMF	AWEIRDRLLA	ERVCDNDTVP	SVSSINRIIR	TKVQQPPNQP
VPASSHSIVS	TGSVTQVSSV	STDSAGSSYS	ISGILGITSP	SADTNKRKRD
EGIQESPVPN	GHSLPGRDFL	RKQMRGDLFT	QQQLEVLDRV	FERQHYSDIF
TTTEPIKPEQ	TTEYSAMASL	AGGLDDMKAN	LASPTPADIG	SSVPGPQSYP
IVTGRDLAST	TLPGYPPHVP	PAGQGSYSAP	TLTGMVPGSE	FSGSPYSHPQ
YSSYNDSWRF	PNPGLLGSPY	YYSAAARGAA	PPAAATAYDR	H

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Robichaud G.A., Nardini M., Laflamme M., Cuperlovic-Culf M., Ouellette R.J. (2004). Human Pax-5 C-terminal isoforms possess distinct transactivation properties and are differentially modulated in normal and malignant B cells. J. Biol. Chem. 279: 49956—49963. PMID 15385562 doi:10.1074/jbc.M407171200
Arseneau J.R., Laflamme M., Lewis S.M., Maicas E., Ouellette R.J. (2009). Multiple isoforms of PAX5 are expressed in both lymphomas and normal B-cells. Br. J. Haematol. 147: 328—338. PMID 19725825 doi:10.1111/j.1365-2141.2009.07859.x
Verkoczy L.K., Berinstein N.L. (1998). Isolation of genes negatively or positively co-expressed with human recombination activating gene 1 (RAG1) by differential display PCR (DD RT-PCR). Nucleic Acids Res. 26: 4497—4507. PMID 9742255 doi:10.1093/nar/26.19.4497
Eberhard D., Jimenez G., Heavey B., Busslinger M. (2000). Transcriptional repression by Pax5 (BSAP) through interaction with corepressors of the Groucho family. EMBO J. 19: 2292—2303. PMID 10811620 doi:10.1093/emboj/19.10.2292
Garvie C.W., Hagman J., Wolberger C. (2001). Structural studies of Ets-1/Pax5 complex formation on DNA. Mol. Cell. 8: 1267—1276. PMID 11779502 doi:10.1016/S1097-2765(01)00410-5

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PAX5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8619 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-11 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q02548 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PAX5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8619 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-11 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q02548 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]