| LEF1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| LEF1, LEF-1, TCF10, TCF1ALPHA, TCF7L3, lymphoid enhancer binding factor 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
MGI: 96770 HomoloGene: 7813 GeneCards: LEF1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| хронічний лімфолейкоз, системний червоний вовчак[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • armadillo repeat domain binding • estrogen receptor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • estrogen receptor activity • gamma-catenin binding • GO:0031493 histone binding • C2H2 zinc finger domain binding • chromatin binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding, bending • DNA binding • sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • beta-catenin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex • beta-catenin-TCF complex • нуклеоплазма • protein-DNA complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• somitogenesis • tongue development • paraxial mesoderm formation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA binding • T cell receptor V(D)J recombination • transcription by RNA polymerase II • cellular response to cytokine stimulus • mammary gland development • negative regulation of interleukin-13 production • odontogenesis of dentin-containing tooth • apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis • cell chemotaxis • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • face morphogenesis • neutrophil differentiation • negative regulation of interleukin-5 production • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • dentate gyrus development • apoptotic process involved in morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of cell growth • regulation of Wnt signaling pathway • embryonic limb morphogenesis • hypothalamus development • branching involved in blood vessel morphogenesis • trachea gland development • regulation of striated muscle tissue development • positive regulation of cell-cell adhesion • forebrain neuroblast division • eye pigmentation • negative regulation of apoptotic process • sprouting angiogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • BMP signaling pathway • positive regulation of cell cycle process • osteoblast differentiation • histone H3 acetylation • formation of radial glial scaffolds • positive regulation of granulocyte differentiation • alpha-beta T cell differentiation • canonical Wnt signaling pathway • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • sensory perception of taste • cellular response to interleukin-4 • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • розвиток клітин • negative regulation of cell-cell adhesion • negative regulation of interleukin-4 production • negative regulation of striated muscle tissue development • positive regulation of cell migration • Wnt • T-helper 1 cell differentiation • positive regulation of cell proliferation in bone marrow • anatomical structure regression • chorio-allantoic fusion • negative regulation of apoptotic process in bone marrow cell • B cell proliferation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • vasculature development • forebrain radial glial cell differentiation • neural crest cell migration • positive regulation of cell population proliferation • forebrain neuron differentiation • histone H4 acetylation • hippocampus development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • steroid hormone mediated signaling pathway • odontoblast differentiation • beta-catenin-TCF complex assembly • Епітеліально-мезенхімальний перехід • regulation of cell-cell adhesion • secondary palate development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 4: 108.05 – 108.17 Mb
| Хр. 3: 130.9 – 131.02 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
LEF1 (англ. Lymphoid enhancer binding factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 44 201[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MPQLSGGGGG
|
|
GGGDPELCAT
|
|
DEMIPFKDEG
|
|
DPQKEKIFAE
|
|
ISHPEEEGDL
|
| ADIKSSLVNE
|
|
SEIIPASNGH
|
|
EVARQAQTSQ
|
|
EPYHDKAREH
|
|
PDDGKHPDGG
|
| LYNKGPSYSS
|
|
YSGYIMMPNM
|
|
NNDPYMSNGS
|
|
LSPPIPRTSN
|
|
KVPVVQPSHA
|
| VHPLTPLITY
|
|
SDEHFSPGSH
|
|
PSHIPSDVNS
|
|
KQGMSRHPPA
|
|
PDIPTFYPLS
|
| PGGVGQITPP
|
|
LGWQGQPVYP
|
|
ITGGFRQPYP
|
|
SSLSVDTSMS
|
|
RFSHHMIPGP
|
| PGPHTTGIPH
|
|
PAIVTPQVKQ
|
|
EHPHTDSDLM
|
|
HVKPQHEQRK
|
|
EQEPKRPHIK
|
| KPLNAFMLYM
|
|
KEMRANVVAE
|
|
CTLKESAAIN
|
|
QILGRRWHAL
|
|
SREEQAKYYE
|
| LARKERQLHM
|
|
QLYPGWSARD
|
|
NYGKKKKRKR
|
|
EKLQESASGT
|
|
GPRMTAAYI
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Waterman M.L., Fischer W.H., Jones K.A. (1991). A thymus-specific member of the HMG protein family regulates the human T cell receptor C alpha enhancer. Genes Dev. 5: 656—669. PMID 2010090 doi:10.1101/gad.5.4.656
- Hovanes K., Li T.W., Waterman M.L. (2000). The human LEF-1 gene contains a promoter preferentially active in lymphocytes and encodes multiple isoforms derived from alternative splicing. Nucleic Acids Res. 28: 1994—2003. PMID 10756202 doi:10.1093/nar/28.9.1994
- Jesse S., Koenig A., Ellenrieder V., Menke A. (2010). Lef-1 isoforms regulate different target genes and reduce cellular adhesion. Int. J. Cancer. 126: 1109—1120. PMID 19653274 doi:10.1002/ijc.24802
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Bruhn L., Munnerlyn A., Grosschedl R. (1997). ALY, a context-dependent coactivator of LEF-1 and AML-1, is required for TCRalpha enhancer function. Genes Dev. 11: 640—653. PMID 9119228 doi:10.1101/gad.11.5.640
- Brantjes H., Roose J., van De Wetering M., Clevers H. (2001). All Tcf HMG box transcription factors interact with Groucho-related co-repressors. Nucleic Acids Res. 29: 1410—1419. PMID 11266540 doi:10.1093/nar/29.7.1410
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|