| DLX5
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| DLX5, SHFM1D, AI385752, distal-less homeobox 5, SHFM1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600028 MGI: 101926 HomoloGene: 3825 GeneCards: DLX5
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| split hand-foot malformation 1 with sensorineural hearing loss[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • HMG box domain binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• skeletal system development • roof of mouth development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • epithelial cell differentiation • аксоноґенеза • осифікація • positive regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • anatomical structure formation involved in morphogenesis • bone morphogenesis • head development • cellular response to BMP stimulus • ear development • осифікація ендохондральна • transcription by RNA polymerase II • BMP signaling pathway • olfactory pit development • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • axon guidance • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • embryonic limb morphogenesis • inner ear morphogenesis • osteoblast differentiation • проліферація • face morphogenesis • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus • GO:1901313 positive regulation of gene expression • olfactory bulb interneuron differentiation • interneuron axon guidance • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 7: 97.02 – 97.02 Mb
| Хр. 6: 6.88 – 6.88 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
DLX5 (англ. Distal-less homeobox 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 289 амінокислот, а молекулярна маса — 31 540[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTGVFDRRVP
|
|
SIRSGDFQAP
|
|
FQTSAAMHHP
|
|
SQESPTLPES
|
|
SATDSDYYSP
|
| TGGAPHGYCS
|
|
PTSASYGKAL
|
|
NPYQYQYHGV
|
|
NGSAGSYPAK
|
|
AYADYSYASS
|
| YHQYGGAYNR
|
|
VPSATNQPEK
|
|
EVTEPEVRMV
|
|
NGKPKKVRKP
|
|
RTIYSSFQLA
|
| ALQRRFQKTQ
|
|
YLALPERAEL
|
|
AASLGLTQTQ
|
|
VKIWFQNKRS
|
|
KIKKIMKNGE
|
| MPPEHSPSSS
|
|
DPMACNSPQS
|
|
PAVWEPQGSS
|
|
RSLSHHPHAH
|
|
PPTSNQSPAS
|
| SYLENSASWY
|
|
TSAASSINSH
|
|
LPPPGSLQHP
|
|
LALASGTLY
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, остеогенез, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|