| TBPL1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TBPL1, MGC:8389, MGC:9620, STUD, TLF, TLP, TRF2, TATA-box binding protein like 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 605521 MGI: 1339946 HomoloGene: 3577 GeneCards: TBPL1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • transcription factor TFIIA complex • клітинне ядро • transcription factor TFIIIB complex • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• spermatid nucleus differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • acrosome assembly • dTTP biosynthetic process • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • DNA-templated transcription, initiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase III preinitiation complex assembly
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 6: 133.95 – 133.99 Mb
| Хр. 10: 22.58 – 22.61 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TBPL1 (англ. TATA-box binding protein like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 186 амінокислот, а молекулярна маса — 20 887[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDADSDVALD
|
|
ILITNVVCVF
|
|
RTRCHLNLRK
|
|
IALEGANVIY
|
|
KRDVGKVLMK
|
| LRKPRITATI
|
|
WSSGKIICTG
|
|
ATSEEEAKFG
|
|
ARRLARSLQK
|
|
LGFQVIFTDF
|
| KVVNVLAVCN
|
|
MPFEIRLPEF
|
|
TKNNRPHASY
|
|
EPELHPAVCY
|
|
RIKSLRATLQ
|
| IFSTGSITVT
|
|
GPNVKAVATA
|
|
VEQIYPFVFE
|
|
SRKEIL
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Rabenstein M.D., Zhou S., Lis J.T., Tjian R. (1999). TATA box-binding protein (TBP)-related factor 2 (TRF2), a third member of the TBP family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4791—4796. PMID 10220372 doi:10.1073/pnas.96.9.4791
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|