| PAX8
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| PAX8, paired box 8, PAX-8 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 167415 MGI: 97492 HomoloGene: 2589 GeneCards: PAX8
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • thyroid-stimulating hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• regulation of apoptotic process • pronephros development • regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation • диференціація клітин • mesonephric tubule development • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • kidney epithelium development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of metanephric DCT cell differentiation • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephric nephron morphogenesis • negative regulation of apoptotic process involved in metanephric collecting duct development • розвиток нирки • pronephric field specification • positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • anatomical structure morphogenesis • metanephric epithelium development • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • regulation of thyroid-stimulating hormone secretion • transcription, DNA-templated • otic vesicle development • metanephric distal convoluted tubule development • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephros development • mesonephros development • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • metanephric nephron tubule formation • multicellular organism development • central nervous system development • metanephric comma-shaped body morphogenesis • branching involved in ureteric bud morphogenesis • thyroid gland development • positive regulation of thyroid hormone generation • negative regulation of apoptotic process involved in metanephric nephron tubule development • S-shaped body morphogenesis • inner ear morphogenesis • urogenital system development • метаболізм сіркових сполук • metanephric S-shaped body morphogenesis • metanephros development • cellular response to gonadotropin stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • thyroid-stimulating hormone signaling pathway • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • ventricular septum development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 113.22 – 113.28 Mb
| Хр. 2: 24.31 – 24.37 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
PAX8 (англ. Paired box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 48 218[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MPHNSIRSGH
|
|
GGLNQLGGAF
|
|
VNGRPLPEVV
|
|
RQRIVDLAHQ
|
|
GVRPCDISRQ
|
| LRVSHGCVSK
|
|
ILGRYYETGS
|
|
IRPGVIGGSK
|
|
PKVATPKVVE
|
|
KIGDYKRQNP
|
| TMFAWEIRDR
|
|
LLAEGVCDND
|
|
TVPSVSSINR
|
|
IIRTKVQQPF
|
|
NLPMDSCVAT
|
| KSLSPGHTLI
|
|
PSSAVTPPES
|
|
PQSDSLGSTY
|
|
SINGLLGIAQ
|
|
PGSDKRKMDD
|
| SDQDSCRLSI
|
|
DSQSSSSGPR
|
|
KHLRTDAFSQ
|
|
HHLEPLECPF
|
|
ERQHYPEAYA
|
| SPSHTKGEQG
|
|
LYPLPLLNST
|
|
LDDGKATLTP
|
|
SNTPLGRNLS
|
|
THQTYPVVAD
|
| PHSPFAIKQE
|
|
TPEVSSSSST
|
|
PSSLSSSAFL
|
|
DLQQVGSGVP
|
|
PFNAFPHAAS
|
| VYGQFTGQAL
|
|
LSGREMVGPT
|
|
LPGYPPHIPT
|
|
SGQGSYASSA
|
|
IAGMVAGSEY
|
| SGNAYGHTPY
|
|
SSYSEAWRFP
|
|
NSSLLSSPYY
|
|
YSSTSRPSAP
|
|
PTTATAFDHL
|
|
|
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|