HSF2

HSF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5D8K, 5D8L
Ідентифікатори
Символи	HSF2, HSF 2, HSTF 2, heat shock transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 140581 MGI: 96239 HomoloGene: 37931 GeneCards: HSF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • protein homodimerization activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • цитоплазма; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • Сперматогенез; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • cellular response to heat; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3298
	15500
	ENSG00000025156
	ENSMUSG00000019878
	Q03933; Q9BS48
	P38533
	NM_004506; NM_001135564; NM_001243094
	NM_008297
	NP_001129036; NP_001230023; NP_004497; NP_001230023.1
	NP_032323
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HSF2 (англ. Heat shock transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 60 348^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKQSSNVPAF	LSKLWTLVEE	THTNEFITWS	QNGQSFLVLD	EQRFAKEILP
KYFKHNNMAS	FVRQLNMYGF	RKVVHIDSGI	VKQERDGPVE	FQHPYFKQGQ
DDLLENIKRK	VSSSKPEENK	IRQEDLTKII	SSAQKVQIKQ	ETIESRLSEL
KSENESLWKE	VSELRAKHAQ	QQQVIRKIVQ	FIVTLVQNNQ	LVSLKRKRPL
LLNTNGAQKK	NLFQHIVKEP	TDNHHHKVPH	SRTEGLKPRE	RISDDIIIYD
VTDDNADEEN	IPVIPETNED	VISDPSNCSQ	YPDIVIVEDD	NEDEYAPVIQ
SGEQNEPARE	SLSSGSDGSS	PLMSSAVQLN	GSSSLTSEDP	VTMMDSILND
NINLLGKVEL	LDYLDSIDCS	LEDFQAMLSG	RQFSIDPDLL	VDLFTSSVQM
NPTDYINNTK	SENKGLETTK	NNVVQPVSEE	GRKSKSKPDK	QLIQYTAFPL
LAFLDGNPAS	SVEQASTTAS	SEVLSSVDKP	IEVDELLDSS	LDPEPTQSKL
VRLEPLTEAE	ASEATLFYLC	ELAPAPLDSD	MPLLDS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Schuetz T.J., Gallo G.J., Sheldon L., Tempst P., Kingston R.E. (1991). Isolation of a cDNA for HSF2: evidence for two heat shock factor genes in humans. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 6911—6915. PMID 1871106 doi:10.1073/pnas.88.16.6911
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Sheldon L., Kingston R.E. (1993). Hydrophobic coiled-coil domains regulate the subcellular localization of human heat shock factor 2. Genes Dev. 7: 1549—1558. PMID 8339932 doi:10.1101/gad.7.8.1549
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5225 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q03933 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5225 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q03933 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]