| HOXA3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXA3, HOX1, HOX1E, homeobox A3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142954 MGI: 96175 HomoloGene: 40725 GeneCards: HOXA3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • HMG box domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • glossopharyngeal nerve morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • thymus development • transcription, DNA-templated • embryonic skeletal system development • multicellular organism development • animal organ formation • blood vessel remodeling • thyroid gland development • cartilage development • parathyroid gland development • Ангіогенез • positive regulation of cell population proliferation • animal organ morphogenesis • specification of animal organ position • anterior/posterior pattern specification • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • calcium ion transport • експресія генів • magnesium ion homeostasis • bone mineralization • negative regulation of calcium ion transport • phosphate ion homeostasis • calcium ion homeostasis • positive regulation of receptor binding • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 7: 27.11 – 27.15 Mb
| Хр. 6: 52.15 – 52.19 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXA3 (англ. Homeobox A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 46 369[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQKATYYDSS
|
|
AIYGGYPYQA
|
|
ANGFAYNANQ
|
|
QPYPASAALG
|
|
ADGEYHRPAC
|
| SLQSPSSAGG
|
|
HPKAHELSEA
|
|
CLRTLSAPPS
|
|
QPPSLGEPPL
|
|
HPPPPQAAPP
|
| APQPPQPAPQ
|
|
PPAPTPAAPP
|
|
PPSSASPPQN
|
|
ASNNPTPANA
|
|
AKSPLLNSPT
|
| VAKQIFPWMK
|
|
ESRQNTKQKT
|
|
SSSSSGESCA
|
|
GDKSPPGQAS
|
|
SKRARTAYTS
|
| AQLVELEKEF
|
|
HFNRYLCRPR
|
|
RVEMANLLNL
|
|
TERQIKIWFQ
|
|
NRRMKYKKDQ
|
| KGKGMLTSSG
|
|
GQSPSRSPVP
|
|
PGAGGYLNSM
|
|
HSLVNSVPYE
|
|
PQSPPPFSKP
|
| PQGTYGLPPA
|
|
SYPASLPSCA
|
|
PPPPPQKRYT
|
|
AAGAGAGGTP
|
|
DYDPHAHGLQ
|
| GNGSYGTPHI
|
|
QGSPVFVGGS
|
|
YVEPMSNSGP
|
|
ALFGLTHLPH
|
|
AASGAMDYGG
|
| AGPLGSGHHH
|
|
GPGPGEPHPT
|
|
YTDLTGHHPS
|
|
QGRIQEAPKL
|
|
THL
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|