| NEUROD2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NEUROD2, NDRF, bHLHa1, neuronal differentiation 2, EIEE72, DEE72 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601725 MGI: 107755 HomoloGene: 4489 GeneCards: NEUROD2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• cellular response to calcium ion • regulation of neuron differentiation • диференціація клітин • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • positive regulation of calcium-mediated signaling • associative learning • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • neuron development • transcription by RNA polymerase II • behavioral fear response • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • positive regulation of synaptic plasticity • negative regulation of synapse maturation • multicellular organism development • positive regulation of synapse maturation • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of neuron differentiation • cerebellar cortex development • regulation of synapse maturation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to electrical stimulus
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 17: 39.6 – 39.61 Mb
| Хр. 11: 98.22 – 98.22 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
NEUROD2 (англ. Neuronal differentiation 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 41 361[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLTRLFSEPG
|
|
LLSDVPKFAS
|
|
WGDGEDDEPR
|
|
SDKGDAPPPP
|
|
PPAPGPGAPG
|
| PARAAKPVPL
|
|
RGEEGTEATL
|
|
AEVKEEGELG
|
|
GEEEEEEEEE
|
|
EGLDEAEGER
|
| PKKRGPKKRK
|
|
MTKARLERSK
|
|
LRRQKANARE
|
|
RNRMHDLNAA
|
|
LDNLRKVVPC
|
| YSKTQKLSKI
|
|
ETLRLAKNYI
|
|
WALSEILRSG
|
|
KRPDLVSYVQ
|
|
TLCKGLSQPT
|
| TNLVAGCLQL
|
|
NSRNFLTEQG
|
|
ADGAGRFHGS
|
|
GGPFAMHPYP
|
|
YPCSRLAGAQ
|
| CQAAGGLGGG
|
|
AAHALRTHGY
|
|
CAAYETLYAA
|
|
AGGGGASPDY
|
|
NSSEYEGPLS
|
| PPLCLNGNFS
|
|
LKQDSSPDHE
|
|
KSYHYSMHYS
|
|
ALPGSRPTGH
|
|
GLVFGSSAVR
|
| GGVHSENLLS
|
|
YDMHLHHDRG
|
|
PMYEELNAFF
|
|
HN
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|