| ZNF34
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ZNF34, KOX32, zinc finger protein 34 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 194526 HomoloGene: 88920 GeneCards: ZNF34
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 8: 144.77 – 144.79 Mb
| н/д
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| н/д |
|---|
| Вікідані |
|
ZNF34 (англ. Zinc finger protein 34) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 560 амінокислот, а молекулярна маса — 64 038[3].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MLLLLSDQLL
|
|
LTALRKPNPQ
|
|
AMAALFLSAP
|
|
PQAEVTFEDV
|
|
AVYLSREEWG
|
| RLGPAQRGLY
|
|
RDVMLETYGN
|
|
LVSLGVGPAG
|
|
PKPGVISQLE
|
|
RGDEPWVLDV
|
| QGTSGKEHLR
|
|
VNSPALGTRT
|
|
EYKELTSQET
|
|
FGEEDPQGSE
|
|
PVEACDHISK
|
| SEGSLEKLVE
|
|
QRGPRAVTLT
|
|
NGESSRESGG
|
|
NLRLLSRPVP
|
|
DQRPHKCDIC
|
| EQSFEQRSYL
|
|
NNHKRVHRSK
|
|
KTNTVRNSGE
|
|
IFSANLVVKE
|
|
DQKIPTGKKL
|
| HYCSYCGKTF
|
|
RYSANLVKHQ
|
|
RLHTEEKPYK
|
|
CDECGKAFSQ
|
|
SCEFINHRRM
|
| HSGEIPYRCD
|
|
ECGKTFTRRP
|
|
NLMKHQRIHT
|
|
GEKPYKCGEC
|
|
GKHFSAYSSL
|
| IYHQRIHTGE
|
|
KPYKCNDCGK
|
|
AFSDGSILIR
|
|
HRRTHTGEKP
|
|
FECKECGKGF
|
| TQSSNLIQHQ
|
|
RIHTGEKPYK
|
|
CNECEKAFIQ
|
|
KTKLVEHQRS
|
|
HTGEKPYECN
|
| DCGKVFSQST
|
|
HLIQHQRIHT
|
|
GEKPYKCSEC
|
|
GKAFHNSSRL
|
|
IHHQRLHHGE
|
| KPYRCSDCKK
|
|
AFSQSTYLIQ
|
|
HRRIHTGEKP
|
|
YKCSECGKAF
|
|
RHSSNMCQHQ
|
| RIHLREDFSM
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|